环境稽核(Environmental Auditing, EA)是针对企业在其产品、活动及服务上对环境保护所造成的影响，进行一有系统性的全面分析，其做法是在某一特定时段内进行评估作业，其检讨的对象仅为环境管理系统。根据ISO14001的要求，在一个管理系统之中，必须建立适当的稽核程序。稽核是一项系统化与文件化过程，藉由抽样检查的方式，查验管理系统与稽核准则是否相符。利用此系统化的稽核工具，可用来检核企业的管理系统、政策、营运及政府在环境资源上的方向，提供事实基础以利决策制定、提升企业员工对环保课题的认知、找出节省成本支出的方法、提高企业在外界心目中的公信力及形象，同时，能够及早对可能发生的事故提出警讯，做好预防措施及改善修正。此稽核作业是一项持续性的工作，需要有专业且具经验的人员来负责规划及执行。关于稽核程序的建立可参考ISO14011，并针对组织内部的特性进行适当的修正。另外，需了解ISO 14000 系列标准除透过企业内部稽核来查看系统的执行状况，亦包括外部稽核及第三者验证制度。